Batman ve Robin'e bu maceralarında Ninja Kaplumbağalar'ın da katılmasıyla kalabalıklaşan kahramanlarımız, kendilerinden daha kalabalık bir ekiple mücadele ediyor. Gotham'a Ra's Al Ghul ve onun Suikastçılar Birliği ile iş birliği yapmaya gelen Shredder ve Ayak Takımı'nı durdurmaya çalışacak olan Batman ve yeni arkadaşlarının yoluna Joker, Harley Quinn, Mr, Freeze ve Bane gibi kötüler de çıkıyor.